【精彩回顧】第一屆農業基因組學青年學術研討會
2019.10.29

2019年10月26日,由青島農業大學、安諾優達生命科學研究院主辦、安諾優達基因科技(北京)有限公司承辦的“第一屆農業基因組學青年學術研討會”在青島農業大學順利召開。會議有幸邀請到來自中國科學院微生物研究所、遺傳與發育研究所、海洋研究所、中國中醫科學院中藥研究所、中國水產科學研究院黃海水產研究所、北京市農林科學院、西北農林科技大學、云南師范大學、青島農業大學等多家單位的專家蒞臨,吸引了眾多農業基因組領域優秀青年學者參與,與會者們就如何推動基因組學在農業研究中的應用展開深入交流和探討。

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下面小編就帶大家回顧下本屆會議的精彩內容:

本屆會議由青島農業大學黨委副書記王慶軍和安諾優達副總裁高玉池分別致開幕辭。王慶軍書記回顧了青島農業大學的發展歷程并預祝本次會議圓滿成功。高玉池副總裁表示在技術不斷升級革新、成本不斷下降的情況下,安諾優達將依托完備的測序平臺和豐富的研發經驗,不斷提供更快速、更高質量、更具有特色的基因組學技術服務,立足生命科學研究和產業轉化,持續為用戶提供更優質的產品和服務。

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                                           安諾優達基因科技副總裁 高玉池                           青島農業大學黨委副書記 王慶軍

本次會議上來自中科院微生物研究所的胡松年研究員介紹了過去十幾年植物基因組學的發展歷程,從技術、方法、研究方向等多個角度詳細闡釋了植物基因組學的發展現狀、面臨的挑戰和未來趨勢。基于植物基因組面臨的一些研究挑戰,如多倍化、高雜合、高重復序列、超大基因組等,胡松年研究員還介紹了其研究團隊在幾個植物物種中最新的研究工作,利用多平臺、多技術方案解決復雜植物基因組組裝問題。

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中科院微生物研究所 胡松年研究員

中科院遺傳與發育所的梁承志研究員重點介紹了如何依靠三代單分子長片段測序、光學圖譜、遺傳圖譜、Hi-C等技術進行高質量的參考基因組組裝,并利用比較基因組方法對這些基因組的進化和某些功能基因進行分析。此外,梁承志研究員還重點介紹了其研究團隊開發的一個利用三代測序長片段進行基因組復雜區域組裝的新方法——HERA,該方法已在玉米、苦蕎等多個物種中進行測試,與已發表版本進行對比,組裝質量提升顯著,特別是高度復雜的植物基因組。這些高質量的基因組將用于構建泛基因組,提供更加精細的從基因型到表型的關聯,為分子設計育種奠定堅實的基礎。

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中科院遺傳與發育研究所  梁承志研究員

來自西北農林科技大學的宋衛寧教授重點介紹了其在小麥基因組學上的研究工作。小麥和大麥是極為重要的糧食作物,由于其基因組的龐大和復雜,基因組學研究需要極大規模的投入,以及各種不同技術的整合。它們屬于人類最早馴化的植物,因此而奠定了人類文明的基礎。采集、保存及研究小麥和大麥的野生祖先,無論在理論和實際上都具有重大意義,影響深遠。

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西北農林科技大學 宋衛寧教授

中國中醫科學院中藥研究所的孫偉副研究員介紹了其團隊在藥用植物穿心蓮基因組上的研究工作。中醫藥是寶貴的民族財富,孫偉老師團隊利用基因組學技術解析了穿心蓮基因組序列,并結合代謝組學、轉錄組學等技術手段研究穿心蓮重要代謝物質穿心蓮內酯合成通路。同時,孫偉老師還介紹了其在梔子花基因組學研究上的最新工作進展。

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中國中醫科學院中藥研究所 孫偉副研究員

來自中國中醫科學院中藥研究所的張玉軍研究團隊的冷梁博士以紫蘇為研究對象,對中草藥植物基因組起源進化和次生代謝產物多樣性問題進行研究。通過結合基因組組裝分析、重測序和其它表型分析數據解析了紫蘇在種子大小、節間距、開花期調控等重要生物學性狀上的最新研究進展。

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中國中醫科學院中藥研究所 冷梁博士

青島農業大學的張忠華教授系統地分享了其近幾年在葫蘆科植物中所進行的比較基因組學研究成果。其研究團隊主要通過對黃瓜、西瓜、甜瓜、冬瓜等不同的葫蘆科植物的基因組信息進行比較分析,闡釋不同的果實形態和風味多樣性在基因組層面是如何演化的,以及后續是如何將這些演化信息應用到重要功能基因的解析中。同時,張忠華教授還介紹了其團隊在葫蘆科植物的馴化和育種選擇方面的工作。

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青島農業大學 張忠華教授

北京農林科學院的效曾研究員重點分享了其實驗室在植物miRNA預測、注釋和miRNA數據庫等方面的研究。miRNA是一類重要的轉錄后調控因子,高通量的測序技術為發現和鑒定植物中的miRNA提供了有力的數據支持。楊效曾研究員團隊通過對植物miRNA特點的系統研究,挖掘和解析高通量的小RNA數據,開發出能夠準確、高效地鑒定和注釋植物miRNA的miRDP系列工具,并構建了植物綜合miRNA數據庫——PmiREN(www.PmiREN.com),為植物miRNA相關研究提供了很大地便利。

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北京農林科學院 楊效曾研究員

安諾優達生物信息項目總監劉濤博士介紹了安諾優達在云平臺和三代基因組組裝方面的最新進展。重點介紹了安諾云在數據存儲、交付和分析方面的高安全、高速度和高靈活度等技術優勢,以及與阿里云合作開發的基于批量計算的WDL-Canu組裝糾錯流程,解決了傳統Canu分析流程周期慢、資源消耗多的問題,將基因組組裝周期大幅縮短。此外,劉濤博士還介紹了安諾優達開發的基于多組學大數據的整體解決方案。          

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安諾優達生物信息項目總監 劉濤博士

中國科學院海洋研究所張曉軍研究員介紹了其研究團隊在凡納濱對蝦上的研究工作。對蝦基因組是世界上公認的高復雜基因組,阻礙了多個國際科研機構的研究步伐。張曉軍研究員團隊通過多種技術手段最終完成了凡納濱對蝦基因組測序和組裝,獲得了對蝦基因組參考圖譜。在對蝦基因組上發現了大量的物種特異性基因和大量的串聯重復基因,它們可能與對蝦科的特異性進化有密切聯系。運用多組學數據并結合比較基因組初步分析了對蝦環境適應的蛻皮調控、視覺感受、神經傳導等方面的分子機理。

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中國科學院海洋研究所 張曉軍研究員

中國水產科學研究院黃海水產研究所邵長偉研究員簡要介紹了表觀遺傳的發展歷程以及表觀遺傳的生物學現象,進而以半滑舌鰨為例,詳細介紹表觀遺傳在魚類性別決定和分化中的作用機制。最后通過介紹表觀水平的分子育種技術(如EWAS、epiQTL等),闡述表觀遺傳在魚類分子育種中的應用潛力。

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中國水產科學研究院黃海水產研究所 邵長偉研究員

云南師范大學的祝光濤研究員利用基因組、轉錄組和代謝組等生物大數據對番茄育種歷史進行解析,全面分析了番茄果實大小和風味品質變化的遺傳學基礎和選擇驅動力,解析了番茄馴化和現代育種過程中番茄大小和果實代謝組的變化的遺傳基礎,為番茄的育種歷史的解析和風味育種提供了重要的價值。同時,祝光濤研究員還介紹了其團隊在馬鈴薯育種方面的最新研究工作。

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云南師范大學 祝光濤研究員

2019年“第一屆農業基因組學青年學術研討會”已圓滿結束,感謝各位專家的精彩分享,感謝各位參會嘉賓。此次會議雖已結束,但科研探索的精神不止。安諾優達將持續為廣大科研伙伴提供更優質更專業的測序服務,助力科學研究。


張忠華教授


張忠華,教授,博士生導師。入選中組部“萬人計劃”科技創新領軍人才和青年拔尖人才,獲 “中國青年科技獎”,第二完成人獲2018年國家自然科學二等獎,第一完成人獲2018年中國農業科學院青年科技創新獎。中國園藝學會分子育種分會秘書長、青年分會常務理事,Journal of Integrative Agriculture (JIA)Horticultural Plant Journal等期刊編委,中央國家機關青聯委員,全國青聯常委。在NatureScienceCell等期刊共發表SCI論文42篇,累計影響因子超過400,共被引用6000余次。主持國家重點研發計劃課題1項,2013年獲國家自然科學基金委“優秀青年”科學基金項目,主持國家自然科學基金面上項目3項,主持國家973和863計劃子課題。


安諾優達生命科學研究院


2018年7月安諾優達生命科學研究院正式獲批成立,研究院以利用生命科學技術推動科學研究及人類健康事業的發展為主線,以浙江安諾優達生物科技有限公司為依托,建設成國際知名的以基因組學、轉錄組學、表觀組學等多組學為核心的研究中心、一流的測序中心和大型數據處理超級計算中心、三維基因組學研究中心和單細胞多組學研究中心,利用生命科學技術不斷推動科學研究及人類健康事業的發展。

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